HCV Genotype, Γονότυπος HCV μετά από ποσοτικοποίηση, HCV Genotyping, HCV Γονότυπος, Γονότυπος HCV
|
Κλινική χρησιμότητα |
Ως οδηγός για τη διάρκεια της θεραπείας σε ασθενείς με χρόνια ηπατίτιδα C |
Προετοιμασία εξεταζομένου |
Δεν υπάρχει καμία ειδική διαιτητική απαίτηση πριν από τη συλλογή δείγματος |
Δείγμα |
Πλάσμα EDTA ή ορός που συλλέγεται σε συνήθη σωληνάρια δειγματοληψίας ή σε σωληνάρια που περιέχουν γέλη διαχωρισμού χωρίς έντονη αιμόλυση ,ίκτερο και έντονη λιπαιμικότητα. Αποχωρίζεται τον ορό από το θρόμβο ή τα κύτταρα εντός 2 ωρών και συντηρείται σε πλαστικό σωληνάριο. |
Σταθερότητα δείγματος |
Για 72 ώρες σε θερμοκρασία 15-25 °C ή για 7ημέρες στους 2-8 °C ή για 6 μήνες στους -20°C. |
Μη αποδεκτό δείγμα |
Δείγματα πλάσματος ηπαρίνης, αιμολυμένα δείγματα, δείγματα που δεν διαχωρίζονται εντός 6 ωρών από τη συλλογή τους ή δείγματα που εκτίθενται σε επαναλαμβανόμενη κατάψυξη/ απόψυξη |
Μεταφορά δείγματος |
2x1,5mL ως ελάχιστος όγκος σε θερμοκρασία ≤-10°C |
Μέθοδος |
RT-PCR and LiPA reverse-hybridisation
95% για επίπεδα HCV RNA >1.000 IU/mL |
Τιμές αναφοράς |
Έκθεση αποτελεσμάτων |
Παρατηρήσεις |
- Ένα από τα σημαντικότερα χαρακτηριστικά των γονιδιωμάτων του ΗCV είναι η γενετική ποικιλομορφία τους, φαινόμενο που προσδιορίζει μία κοινή φυσική ιδιότητα πολλών RNA ιών όπως και του HIV.
- Τα διάφορα στελέχη του ΗCV μπορούν να ταξινομηθούν σε διακριτούς γονοτύπους (τύπους και υποτύπους). Με εφαρμογή της μεθόδου της φυλογενετικής ανάλυσης οι τύποι, οι υπότυποι και τα στελέχη (isolates) του ΗCV διακρίνονται με βάση την ποσοστιαία κατά μέσο όρο διαφοροποίηση επί της συνολικής αλληλουχίας των νουκλεοτιδίων τους κατά περίπου 30%, 20% και 10% αντίστοιχα.
- Περιγράφονται έξι κύριοι τύποι του HCV (1 - 6) οι οποίοι περεταίρω διακλαδίζονται σε περισσότερους των 80 υποτύπων που αναγνωρίζονται από την προσθήκη μικρών στοιχείων της αλφαβήτου (1α, 1b, 1c κτλ.)
- Ο γονότυπος είναι ένα ενδογενές χαρακτηριστικό των μεταδιδομένων στελεχών του ΗCV και δεν τροποποιείται κατά τη διάρκεια της φυσικής ιστορίας της συγκεκριμένης λοίμωξης.
- Ιός της ηπατίτιδας C (HCV) προσδιορισμός γονοτύπου ΔΕΝ πρέπει να χρησιμοποιείται ως διαγνωστική εξέταση για HCV λοίμωξη. It should be requested only on patients confirmed to be actively infected with HCV. Θα πρέπει να ζητούνται μόνο για τους ασθενείς επιβεβαίωσαν την ενεργό μολυνθεί με HCV.
- Αρνητικό ή ασαφές αποτέλεσμα HCV γονότυπο δεν αποκλείει ενεργό λοίμωξη HCV. Test results should be correlated with routine serologic and molecular-based testing, as well as clinical presentation. Τα αποτελέσματα των δοκιμών θα πρέπει να συσχετιστούν με τη ρουτίνα των ορολογικών και μοριακών δοκιμών, καθώς και κλινική εικόνα.
- Η δοκιμασία απαιτεί ένα επίπεδο πλάσματος ιικού RNA τουλάχιστον 1000 IU /mL. Αν μια ποσοτική δοκιμασία του HCV RNA δεν έχει γίνει τις τελευταίες 90 ημέρες, θα πρέπει να εκτελεστεί από το εργαστήριο, και χρεώνεται ξεχωριστά. Η εντολή γονοτύπου HCV θα ακυρωθεί / πιστωθεί από το εργαστήριο, αν το ιικό RNA επίπεδο είναι <1000 IU / ml.
|
Εκτέλεση |
5-9 ημέρες |